Evaluasi Kuliah minggu ini

Minggu ini saya 3 kali mengajar. Senin : struktur data dan algoritma I, selasa : pengantar bioinformatika, jumat : struktur data dan algoritma I. Senin dan Jumat sama materinya, tapi kelasnya berlainan.

Untuk hari Senin, rasanya saya kurang berhasil. Sambungan cerita dari satu slide ke slide yang lain tidak smooth. Mungkin karena saya tidak persiapan lebih baik, disamping juga alur ceritanya kurang bagus. Nilai : C.

Untuk hari Selasa, karena materi riset, jadi bisa lebih pede cerita. Sayang kelas nya terlalu besar, untuk sekitar 13 siswa saja. Anak-anak lebih suka duduk jauh di belakang, entah sambil baca apa, atau nyelesaiin laporan mereka sendiri-sendiri. Saya puas, dan bisa mengajar dengan enak, tapi komunikasi kurang terbangun. Jadi nilai B saja.

Untuk hari Jumat, materi sama dengan Senin, dan saya bisa memperbaiki missing link antara satu slide dengan slide yang lain. Komunikasi juga bisa sedikit terbentuk, walau anak-anak masih malu-malu kuciang. Nilai A.

Siswa di kelas Jumat kesan saya lebih tenang/serius daripada kelas Senin. Agak kebalikan dari pattern tahun-tahun sebelumnya. Biasanya anak yang absensinya di awal (berarti group Senin) lebih bagus baik nilai maupun attitude-nya saat mengikuti kuliah. Tahun ini saya dengar dari sensei lain polanya terbalik. Tapi karena ini baru kuliah pertama, masih terlalu dini untuk membuat kesimpulan.

語彙 (1)

Vocabulary (語彙)

1. 示唆（しさ）：それとなく気づかせること
2. 仮に（かりに）：一時の間に合せとして
3. 該当：その条件・事例・資格などにあてはまること
4. 当該：そのこと、そのもの
5. 分泌：腺(せん)細胞が特殊な代謝産物を生成・排出する機能 (sekresi)
6. 付与:さずけあたえること (to give)
7. 駆動：動力を与えて動かすこと
8. 莫大（ばくだい）：きわめて大きいさま
9. 営む（いとなむ）：to perform, to conduct
10. 養う(やしなう)：養育する
11. 全貌（ぜんぼう）：物事の全体のすがた
12. 骨格(こっかく)：物事をかたちづくる中心となる部分
13. 幸運（こううん）
14. 普遍性：すべての場合にあてはまる可能性、一般性
15. 突き当たる
16. 組成（組成）：複数の要素・成分をくみたてて成ること
17. Apa beda antara推定、推察 dan 推測 ?
    1. 推定：推測して決定すること (estimate)
    2. 推察：事情や相手の心中をおしはかること。おもいやること (to guess)
    3. 推測：(ある事柄に基づいて)おしはかること　sepertinya sama dengan 推定, hanya saja kalau 推定 itu mengandung satu keputusan
18. Apa beda antara 解析 dan 分析
    1. 解析：物事をこまかく解き開き、理論に基づいて研究すること
    2. 分析：ある物事を分解して、それを成立させている成分・要素・側面を明らかにすること
19. 保守的:新しいものをきらい　(conservative)
20. 収斂（しゅうれん）：収縮すること
21. さまつ（瑣末）な：わずかなこと
22. 機構：機械の内部構造 (structure)
23. 絡み合う（からみあう）:複雑に関係し合う

Bioinformatika dari sudut pandang Life Science

Tema untuk kuliah kedua adalah bioinformatika dari sudut pandang life science (生命科学からみた生物情報科学). Materi yang saya ajarkan berasal dari bab ke-2 buku takagi sensei. Text untuk bab ini ditulis oleh Saigo sensei. Kesan saya　untuk bab ini, materinya cukup berat, dan memerlukan dasar biologi yang memadai untuk memahami penjelasannya. Padahal di sampul buku ini dipromosikan kalau materinya bisa diikuti walau tanpa senmon chishiki. Walau begitu, saya rasa agak berat bagi mahasiswa/i saya. Kemarin saat saya tanya: siapa yang pernah mengikuti kuliah biologi, hanya 1 anak yang mengacungkan jari. Berarti yang lain berangkat dari nol. Juga materi pada bab ini penjelasannya terlalu banyak berputar-putar di development & differentiation (発生分化), dan kurang pas dengan judul yang ditawarkan. Sepertinya ada missing link antara judul dan isi. Berarti untuk kuliah yad., saya harus jabarkan bab ini ke dalam beberapa quiz yang sekiranya membuat siswa tertarik mengikuti daripada sekedar bentuk paparan saja. Mungkin harus dibuat penjelasan, apakah beda antara bioinformatika, biologi (seibutsu gaku), dan life science (seimei kagaku).

Kuliah bioinformatics (Fall Semester)

Hari-hari ini menyiapkan materi kuliah bioinformatika yg akan mulai sejak minggu depan. Awalnya saya ragu, jangan-jangan peminatnya sedikit. Sore ini saya cek ke kyoumuka. Kata Ishida san, sementara ini 13 siswa (B3) telah mendaftar untuk mengikuti kuliah ini. Tapi masih ada kemungkinan akan bertambah pada minggu yad. Wah, lumayan juga. Saya nggak ngira akan sebanyak ini, karena sudah mulai spesifik. Juga di syllabus jelas saya tulis kalau akan ada tes dan PR tiap kali masuk kuliah. Jadi yang cukup punya nyali saja yang ikut kuliah ini. Lagian bukan matkul wajib (必修科目), melainkan pilihan. Koq banyak juga yang ikut ya ? Apakah karena tema bioinformatika ini menarik bagi mereka ?

Singkat cerita, sore ini saya mau nggak mau harus menyiapkan materi yang menarik. Apalagi sebenarnya banyak sekali hal yang belum saya fahami dari bidang ini. Jadi belajar lagi dari nol, terutama pada bagian dasar-dasar biologi molekuler.

Rencana kuliah saya sbb.

1. バイオインフォマティクスとは (Apakah bioinformatika itu ?)
2. 生命科学からみた生物情報科学 (Bioinformatika dari sudut pandang life science)
3. 仮想化人体論の基礎 (Teori dasar Virtual body)
4. DNA、RNAと淡白質 (DNA, RNA dan Protein)
5. ヒトゲノムプロジェクトそしてポストゲノム時代 (Human Genome Project & riset pada era sesudahnya)
6. 遺伝子発現解析 (Analisa ekspresi gen)
7. 淡白質立体構造概論 (Prediksi struktur protein)
8. データベースの利用 (Pemakaian database pada bioinformatika)
9. パターン認識とバイオインフォマティクスへの応用（1：特徴抽出） (Pattern Recognition pada Bioinformatika bag. 1: Feature extraction)
10. パターン認識とバイオインフォマティクスへの応用（2：ニューラルネットワーク、遺伝的アルゴリズム） (Pattern Recognition pada Bioinformatika bag. 2:Neural Networks & Genetic Algorithm)
11. データマイニングと知識発見 (Datamining & Knowledge Discovery dalam bioinformatika)
12. 膨大な遺伝子情報から機能を探る方法 (Mencari knowledge dari informasi genetik)
13. 配列から生物学的な意味を探る (Bagaimana menemukan makna biologi dari sekuens ?)
14. バイオインフォマティクスの最近の動向（1） (Trend riset bioinformatika 1)
15. バイオインフォマティクスの最近の動向（2） (Trend riset bioinformatika 2)

Tahun ini jadwal kuliah hanya 13 kali. Jadi ada beberapa materi yang tidak disampaikan, atau hanya diberikan ringkasannya. Selanjutnya diserahkan kepada masing-masing siswa untuk belajar sendiri.

Untuk PR dan mini test, rencananya sementara sbb. :

PR: Membuat slide yang menjelaskan satu konsep yang telah diajarkan (semacam penyegaran). Mini test : Pada pertemuan berikutnya, siswa diminta menjelaskan secara tertulis slide yang dibuat tsb. Alokasi waktu sekitar 5-10 menit. Dengan demikian siswa akan terlatih untuk menangkap esensi dari satu konsep yang dijelaskan, dan mampu menjelaskannya secara ringkas.

Diproteksi: Natsu Camp KMI Nagoya di Kasugai (16-17 September 2006)

Tulisan ini dilindungi kata sandi. Untuk melihatnya mohon masukkan sandi Anda di bawah ini:

Kata Sandi: