Hari-hari ini menyiapkan materi kuliah bioinformatika yg akan mulai sejak minggu depan. Awalnya saya ragu, jangan-jangan peminatnya sedikit. Sore ini saya cek ke kyoumuka. Kata Ishida san, sementara ini 13 siswa (B3) telah mendaftar untuk mengikuti kuliah ini. Tapi masih ada kemungkinan akan bertambah pada minggu yad. Wah, lumayan juga. Saya nggak ngira akan sebanyak ini, karena sudah mulai spesifik. Juga di syllabus jelas saya tulis kalau akan ada tes dan PR tiap kali masuk kuliah. Jadi yang cukup punya nyali saja yang ikut kuliah ini. Lagian bukan matkul wajib (必修科目), melainkan pilihan. Koq banyak juga yang ikut ya ? Apakah karena tema bioinformatika ini menarik bagi mereka ?
Singkat cerita, sore ini saya mau nggak mau harus menyiapkan materi yang menarik. Apalagi sebenarnya banyak sekali hal yang belum saya fahami dari bidang ini. Jadi belajar lagi dari nol, terutama pada bagian dasar-dasar biologi molekuler.
Rencana kuliah saya sbb.
- バイオインフォマティクスとは (Apakah bioinformatika itu ?)
- 生命科学からみた生物情報科学 (Bioinformatika dari sudut pandang life science)
- 仮想化人体論の基礎 (Teori dasar Virtual body)
- DNA、RNAと淡白質 (DNA, RNA dan Protein)
- ヒトゲノムプロジェクトそしてポストゲノム時代 (Human Genome Project & riset pada era sesudahnya)
- 遺伝子発現解析 (Analisa ekspresi gen)
- 淡白質立体構造概論 (Prediksi struktur protein)
- データベースの利用 (Pemakaian database pada bioinformatika)
- パターン認識とバイオインフォマティクスへの応用（1：特徴抽出） (Pattern Recognition pada Bioinformatika bag. 1: Feature extraction)
- パターン認識とバイオインフォマティクスへの応用（2：ニューラルネットワーク、遺伝的アルゴリズム） (Pattern Recognition pada Bioinformatika bag. 2:Neural Networks & Genetic Algorithm)
- データマイニングと知識発見 (Datamining & Knowledge Discovery dalam bioinformatika)
- 膨大な遺伝子情報から機能を探る方法 (Mencari knowledge dari informasi genetik)
- 配列から生物学的な意味を探る (Bagaimana menemukan makna biologi dari sekuens ?)
- バイオインフォマティクスの最近の動向（1） (Trend riset bioinformatika 1)
- バイオインフォマティクスの最近の動向（2） (Trend riset bioinformatika 2)
Tahun ini jadwal kuliah hanya 13 kali. Jadi ada beberapa materi yang tidak disampaikan, atau hanya diberikan ringkasannya. Selanjutnya diserahkan kepada masing-masing siswa untuk belajar sendiri.
Untuk PR dan mini test, rencananya sementara sbb. :
PR: Membuat slide yang menjelaskan satu konsep yang telah diajarkan (semacam penyegaran). Mini test : Pada pertemuan berikutnya, siswa diminta menjelaskan secara tertulis slide yang dibuat tsb. Alokasi waktu sekitar 5-10 menit. Dengan demikian siswa akan terlatih untuk menangkap esensi dari satu konsep yang dijelaskan, dan mampu menjelaskannya secara ringkas.
