Kelas “Bioinformatics”

Hari ini adalah terakhir saya mengajar “Introduction to Bioinformatics” untuk semester ini di jurusan Biomedical Engineering, SGU. Hari ini tadi mengulang hal-hal yang telah diajarkan, plus melanjutkan topik datamining dalam bioinformatika. Dua minggu berturut-turut saya mengenalkan secara “kilat” dan “short-cut”, mengenai datamining dan beberapa metodenya, yaitu association rule, k-nearest-neighbor classifier, artificial neural network dan support vector machine. Saya hanya menjelaskan konsep dasarnya saja, karena sekaligus mengajarkan praktek memakai software datamining “WEKA” untuk menganalisa data ekspresi gen, sebagai contoh kasus penerapan datamining bioinformatika. Tool klasifikasi yang dipakai dari Weka adalah 3 yang dijelaskan di atas: k-nearest-neighbor classifier, artificial neural network dan support vector machine. Sedangkan datanya saya ambil dari paper: Classification and diagnostic prediction of cancers using gene expression profiling and artificial neural networks, J. Khan, et al., Nature Medicine 7, pp.673-679, 2001. Setelah kelas selesai, anak-anak inisiatif untuk mengambil foto bersama. Here it is :

back, left to right: Uni, Nisya, Iboi, Mami
front, left to right: Anto, Rudolf

PS: Uni..thanks for the pictures.

Iklan

Tentang Anto Satriyo Nugroho

My name is Anto Satriyo Nugroho. I am working as research scientist at Center for Information & Communication Technology, Agency for the Assessment & Application of Technology (PTIK-BPPT : Pusat Teknologi Informasi & Komunikasi, Badan Pengkajian dan Penerapan Teknologi). I obtained my doctoral degree (Dr.Eng) from Nagoya Institute of Technology, Japan in 2003. My office is located in Serpong, Tangerang Selatan City. My research is on pattern recognition and image processing with applied field of interests on biometrics identification & development of computer aided diagnosis for Malaria. Should you want to know further information on my academic works, please visit my professional site at http://asnugroho.net
Pos ini dipublikasikan di kuliah. Tandai permalink.

Tinggalkan Balasan

Isikan data di bawah atau klik salah satu ikon untuk log in:

Logo WordPress.com

You are commenting using your WordPress.com account. Logout / Ubah )

Gambar Twitter

You are commenting using your Twitter account. Logout / Ubah )

Foto Facebook

You are commenting using your Facebook account. Logout / Ubah )

Foto Google+

You are commenting using your Google+ account. Logout / Ubah )

Connecting to %s